Dopo quattro anni di inagibilità per i danni del terremoto, è stata riaperta al culto nel dicembre del 2001

Sorge al sommo del colle di Trevi e con la sua mole e l'elegante campanile completa e caratterizza il profilo dell’abitato.

È intitolata al primo vescovo di Trevi, patrono della città e del comune, che subì il martirio nell'anno 304.
La Passio, di cui rimangono due codici, del 9° e 12° secolo, narra la storia del santo. Di origine armena, fu inviato a reggere la Chiesa locale, ma in seguito all'editto di Diocleziano fu preso e, dopo numerosi supplizi, messo a morte presso un olivo novello che tuttora si può ammirare (Olivo di S. Emiliano).

Il culto del santo patrono è stato sempre vivissimo a Trevi. Nel medioevo e nel rinascimento S. Emiliano si identificava con Trevi stessa, tanto che si diceva "di S. Emiliano" per indicare una cosa o un abitante di Trevi. La festa liturgica viene celebrata il 28 gennaio e la sera della vigilia si svolge "da sempre" la processione dell'Illuminata.

Sicuramente una chiesa esisteva da tempi remoti, ma i resti più antichi che si possono ammirare (tre elegantissime absidi e parte della parete sud) risalgono al 12° secolo.

Fu radicalmente trasformata e ampliata nella seconda metà del '400 e quasi completamente rifatta nella seconda metà dell'Ottocento su progetto dell'architetto Luca Carimini.

Della costruzione rinascimentale rimangono il Portale con il suo timpano in altorilievo, parte della facciata e la porta tamponata sul lato est. La statuetta che la sovrasta è forse del 13° secolo.

L'interno in bello stile neoclassico conserva affreschi del 16° secolo (abside minore e parete sud), altare della Trinità (1585), il magnifico Altare del Sacramento di Rocco da Vicenza (1521) con statue di Mattia di Gaspare da Como, statue lignee del Crocifisso e Cristo deposto (15° sec), due di S. Emiliano (15° e 18° sec.) e statua in travertino del Redentore di Cesare Aureli (1921). Oltre a varie tele, tra cui una deposizione del 17° sec. in sacrestia, meritano attenzione il cippo in cui furono rinvenute le spoglie del martire e la cantoria dell'organo su cui sono raffigurati vari episodi del martirio del santo titolare.

Nel 16° secolo formavano la Perinsigne Collegiata numerosi canonici. Fu canonico a Trevi Ugo Boncompagni, poi assurto al soglio pontificio con il nome di Gregorio XIII, il riformatore del calendario ora in uso, detto appunto "gregoriano"(1583).